Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAF2Q96CS3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAF2Q96CS3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms