Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms