Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEO1Q92859 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEO1Q92859 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms