Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms