Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB4Q8WW32 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB4Q8WW32 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms