Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHDC9Q8NEP7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHDC9Q8NEP7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms