Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP1Q86WV1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP1Q86WV1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms