Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NANOGNBQ7Z5D8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms