Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT28Q7Z3Y7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms