Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms