Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms