Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms