Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6P435 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q6P435 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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