Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms