Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms