Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms