Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD40Q6AI12 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms