Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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