Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms