Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BOLA3Q53S33 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BOLA3Q53S33 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA3Q53S33 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms