Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTLL9Q3SXZ7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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