Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms