Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms