Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTN1Q16799 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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