Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NPTX1Q15818 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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