Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EFNB3Q15768 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms