Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms