Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM53BQ14153 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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