Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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