Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTCH1Q13635 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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