Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL1Q13616 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms