Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms