Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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