Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TIMM17A-201ENST00000367287 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.435e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TIMM17A-203ENST00000482943 2523 ntTSL 27.47□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.045e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 USMG5-202ENST00000337003 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.185e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 USMG5-204ENST00000369815 626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.35e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.445e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RPL22-204ENST00000465387 508 ntTSL 225.94■■□□□ 1.748e-48■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CHCHD2-202ENST00000473095 694 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.246e-19■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 UFC1-206ENST00000483191 617 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.085e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-229ENST00000513027 697 ntTSL 313.92□□□□□ -0.185e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-212ENST00000505461 1005 ntTSL 511.7□□□□□ -0.545e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-208ENST00000503494 843 ntTSL 311.24□□□□□ -0.615e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 310.34□□□□□ -0.755e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-213ENST00000506312 559 ntTSL 510.11□□□□□ -0.795e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-215ENST00000507261 590 ntTSL 39.84□□□□□ -0.835e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.125e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RACK1-220ENST00000508963 581 ntTSL 27.25□□□□□ -1.255e-61■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SOD1-203ENST00000470944 1746 ntTSL 233.45■■■□□ 2.944e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.584e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.064e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ITGA5-211ENST00000552564 4996 ntTSL 215.17■□□□□ 0.026e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.731e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.636e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.786e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.156e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.717e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.767e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.397e-11■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ALG3-206ENST00000446569 967 ntTSL 520.95■□□□□ 0.942e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NRDC-204ENST00000464385 472 ntTSL 27.5□□□□□ -1.212e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 PARK7-205ENST00000460192 567 ntTSL 320.71■□□□□ 0.913e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 PARK7-206ENST00000465354 949 ntTSL 217.24■□□□□ 0.353e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.661e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.81e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 517.53■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 517.34■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.776e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.96e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 318.18■□□□□ 0.52e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ALG3-213ENST00000485912 995 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 DCAF12-201ENST00000361264 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.765e-10■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.127e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SLC25A37-201ENST00000290075 1889 ntTSL 1 (best)23.96■■□□□ 1.438e-12■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.028e-12■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 211.05□□□□□ -0.648e-12■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.824e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.24e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATP5J2-212ENST00000524321 584 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-19■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATP5J2-211ENST00000523680 84 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-19■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATP5J2-208ENST00000485011 597 ntTSL 212.36□□□□□ -0.431e-19■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.617e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.687e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 25.77□□□□□ -1.497e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 UQCRQ-204ENST00000480372 509 ntTSL 221.59■■□□□ 1.052e-28■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.193e-14■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.123e-14■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.418e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.318e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.088e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.668e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.668e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 GRB2-209ENST00000581959 359 ntTSL 36.8□□□□□ -1.328e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 JPT1-207ENST00000481094 382 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-8■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 PARK7-202ENST00000377488 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.197e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RPL13A-210ENST00000484279 794 ntTSL 516.53■□□□□ 0.244e-23■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DIMT1-204ENST00000514605 635 ntTSL 26.53□□□□□ -1.363e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RPL13A-211ENST00000486930 652 ntTSL 318.89■□□□□ 0.615e-59■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 223.66■■□□□ 1.383e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-214ENST00000558544 1399 ntTSL 520.49■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-212ENST00000558347 1525 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPM1-210ENST00000558264 2687 ntTSL 211.76□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.695e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PDCD2-207ENST00000539212 445 ntTSL 321.06■□□□□ 0.965e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PDCD2-213ENST00000544866 710 ntTSL 519.94■□□□□ 0.785e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 311.24□□□□□ -0.613e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 510.94□□□□□ -0.663e-7■□□□□ 11.2
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