Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCGB2A2Q13296 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms