Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms