Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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NR1H3Q13133 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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NR1H3Q13133 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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NR1H3Q13133 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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NR1H3Q13133 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms