Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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