Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXC1Q12948 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXC1Q12948 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXC1Q12948 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXC1Q12948 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXC1Q12948 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXC1Q12948 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXC1Q12948 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXC1Q12948 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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