Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF2Q12933 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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