Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms