Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms