Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms