Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4BQ07343 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms