Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms