Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms