Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494.8 ms