Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MANFP55145 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MANFP55145 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MANFP55145 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MANFP55145 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms