Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PGGT1BP53609 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGGT1BP53609 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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