Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMSP52788 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMSP52788 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMSP52788 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMSP52788 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMSP52788 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms